複数文書の比較

お世話になります。PDFの比較機能を複数の文書に対してまとめて実行する方法はあるのでしょうか？1000ページ程度ある文書の新旧の比較を意味のある形で行いたいため、上位レベルのしおり をキーに事前にファイルを分割しています。結果として100以上のファイルを比較しなければならないため、質問する次第です。自分でもかなり探したのですが、見当たりませんでした。Acrob at Pro DC 17.009.20044を利用しています。お手数おかけしますが、よろしくお願いいたします。